Міністри міністерств вибираються на першому організаційному засіданні шкільного Парламенту. У процесі ділової гри всі учасники шкільного Парламенту відповідно до власних бажань, можливостей і здібностей розподіляються по міністерствах.

За результатами ділової гри в кожному міністерстві вибирається свій міністр. Потім члени міністерства захищають свій вибір, і представляє свого міністра на спільній зустрічі учасників шкільного Парламенту.

Міністр міністерства:

• Організовує діяльність свого міністерства і проводить його засідання 1 раз на тиждень;
• Бере участь в засіданні міністрів;
• Готує виступ учасників свого міністерства на засіданнях шкільного Парламенту;
• Складає план роботи свого міністерства і забезпечує його реалізацію;
• Залучає до роботи свого міністерства учнів і педагогів;
• Аналізує роботу свого міністерства;
• Надає допомогу окремим учасникам свого міністерства;
• Що стосується труднощі звертається за допомогою до Президента шкільного Парламенту і до педагога - організатора.